Na versão para a Wii U é possível jogar com vários comandos.

Wii U GamePad

No caso de estares a jogar sozinho podes jogar apenas no ecrã do Wii U GamePad.

Comando Wii Plus

Podes jogar segurando-o de lado. É possível também utilizar um Comando Wii normal.

Comando Wii Plus + Nunchuk

Comando Wii Plus + Comando Clássico Pro

Também compatível com o Comando Clássico.

Comando Wii U Pro

Comando da Nintendo GameCube

É possível ligar até quatro Comandos da Nintendo GameCube através de um Adaptador de Comandos da Nintendo GameCube. Este é ligado à Wii U através de dois cabos USB que terás de inserir nas entradas presentes na parte da frente e de trás da Wii U.

Consolas Nintendo 3DS e 2DS

É possível utilizar consolas Nintendo 3DS e 2DS como comandos, desde que cada uma delas contenha uma cópia de Super Smash Bros. for Nintendo 3DS.
Se não tens Super Smash Bros. for Nintendo 3DS, podes adquirir e descarregar o software Comando Smash, disponível na Nintendo eShop a partir de 14 de junho de 2015 por €0,99.
Nota: compatível apenas com o modo Smash.