In de Wii U-versie kun je uitdagingen met een thema spelen in de spelstand Missies. Sommige thema's in deze uitdagingen hangen duidelijk samen met de oorspronkelijke games van de personages, terwijl anderen simpelweg unieke overwinningsvoorwaarden hebben.
Voltooi missies om andere vrij te spelen. Terwijl je deze spelstand ontdekt, kom je beloningen en geheime routes tegen.
Er is ook een aparte spelstand voor twee spelers, waarin je samen uitdagingen moet voltooien.