In de Wii U-versie kun je met een aantal verschillende controllers spelen.
Als je alleen speelt, dan kun je het scherm van de Wii U GamePad gebruiken.
Je kunt spelen door hem dwars te houden. Je kunt ook een normale Wii-afstandsbediening gebruiken.
Ondersteunt ook de Traditionele Controller.
Je kunt maximaal vier GameCube Controllers aansluiten met één GameCube Controller-adapter voor Wii U. Sluit de adapter aan op de Wii U met twee USB-kabels. Je kunt de USB-poorten aan de voorkant en aan de achterkant van de Wii U gebruiken.
Je kunt Nintendo 2DS- en 3DS-systemen gebruiken als controllers. Je moet dan wel voor elk systeem een exemplaar van Super Smash Bros. for Nintendo 3DS hebben.
Als je Super Smash Bros. for Nintendo 3DS niet hebt, dan kun je de Smash-controllersoftware kopen en downloaden. Deze is vanaf 14 juni 2015 verkrijgbaar in de Nintendo eShop voor € 0,99.
Opmerking: je kunt je Nintendo 2DS of 3DS alleen in de spelstand Smash als controller gebruiken.