En la versión para Wii U se puede jugar con diferentes mandos.

Wii U GamePad

Si juegas solo, es posible jugar únicamente en la pantalla del Wii U GamePad.

Mando de Wii Plus

Puedes jugar con él sosteniéndolo horizontalmente. También es posible usar un mando de Wii normal.

Mando de Wii Plus + Nunchuk

Mando de Wii Plus + Mando clásico Pro

También compatible con el mando clásico.

Mando Pro de Wii U

Mando de Nintendo GameCube

Es posible conectar hasta cuatro mandos de GameCube usando un adaptador de los mandos de GameCube for Wii U. Conecta el adaptador a la consola Wii U usando dos cables USB. Pueden usarse los puertos USB frontales o posteriores de la consola Wii U.

Consola Nintendo 3DS o 2DS

Es posible usar consolas Nintendo 3DS o 2DS como mandos siempre que cada una cuente con un ejemplar de Super Smash Bros. for Nintendo 3DS.
Si no tienes Super Smash Bros. for Nintendo 3DS, podrás adquirir y descargar el programa Mando Smash para Nintendo 3DS a partir del 14 de junio de 2015 (precio en eShop: 0,99 €).
Nota: solo compatible con el modo Smash.